Jednomanuálový mechanický kuželkový nástroj postavil Josef Kobrle z Lomnice nad Popelkou v roce 1892. 

V roce 1917 byl nástroj ochuzen o cínové prospektové píšťaly, které byly odebrány pro válečné účely. Po roce 1945 kostel postupně chátral a k největšímu poškození došlo po té, co do varhan spadla velká část stropní omítky. Poničené zůstaly nejen kovové i menší dřevěné píšťaly, ale v havarijním stavu se nacházela i traktura, vzdušnice a hrací stůl. V roce 2004 byl kostel darován Obci Chýjice, která díky úsilí tehdejšího starosty Vladislava Chmely zahájila obnovu celého kostela včetně varhan. 

Práce na záchraně nástroje začala již v roce 2006, ale pro nedostatek finančních prostředků byla na několik let zastavena. V 1. etapě byly doplněny chybějící píšťaly, obnovena poničená traktura a překožen plovákový měch. V roce 2012 byla obnova nástroje dokončena dodáním nového ventilátoru, prospektových píšťal a celkovou kompletací s naladěním. Práci provedl varhanář Jan Karel ze Sázavy.